Danijel Žeželj naît à Zagreb, en Croatie, le 1er décembre 1966. Il suit des études à l'Académie des beaux-Arts de Zagreb, où il étudie la peinture classique, la sculpture et l'impression.
Il publie sa première bande dessinée alors qu'il est encore étudiant à l'université. A la fin des années 1980, ses œuvres sont publiées dans de nombreuses revues de BD de l'ancienne Yougoslavie. En 1991, il part vivre à Londres, puis l'année suivante en Italie. En 1993, l'éditeur italien Editori del Grifo publie son premier roman graphique, Il Ritmo Del Cuore (en français : Le Rythme du cœur). Plus de vingt bande dessinées suivront.
En 1995, il part vivre à Seattle, aux États-Unis. Il commence alors à travailler pour la maison d'édition de bandes dessinées DC Comics et dessine de nombreux comics pour leur collection Vertigo. Par ailleurs, il est aussi illustrateur et ses dessins sont publiés par The New York Times Book Review, the San Francisco Bay Guardian, the Stranger et the Washington Chronicle.
À partir de 1997, en collaboration avec la musicienne et compositrice Jessica Lurie, il crée une série de performances multimédias en fusionnant musique et peinture sur le vif. Celles-ci sont présentées lors de festivals et dans des clubs, des églises et des squats à travers l'Europe et les États-Unis.
En 1998, la France connaît ses bandes dessinées par le biais des albums parus aux éditions Mosquito, tandis qu'il crée des mini-séries de comics pour les éditions DC Comics/Vertigo aux États-Unis.
Ses œuvres ont été publiées et exposées en Croatie, Slovénie, Royaume-Uni, Suisse, France, Italie, Pays-Bas, Allemagne, Espagne, Grèce, Suède, Afrique du Sud, Argentine, au Brésil et aux États-Unis. Ses bandes dessinées et illustrations ont été publiées par les éditeurs Mosquito, Panini Comics, Glénat et Dargaud en France ; DC Comics / Vertigo, Wild Storm, Marvel Comics, Dark Horse, Hazard, The New York Times Book Review, Harper's Magazine, San Francisco Guardian, Washington Chronicle aux États-Unis ; Editori del Grifo, Hazard Edizioni en Italie.